显微镜用来观测观测生物或者工业产品的。但是在观测不同性质的时候，就要采用不同的显微镜，才能清楚地了解到被测物的组成。显微镜又分为生物显微镜和金相显微镜。两者之间的差别，不仅在于名字上的叫法不同，还在于它们之间的照明方式，物镜上所采用的材质也会不同。所以当我们观察不同的组织时，就必须了解清楚使用的显微镜有功能。
生物显微镜采用的是透射照明方式，所以观察的物体是透明的。在显微镜当中也有区分出体视显微镜，体视显微镜的工作距离较大，其距离可以到50mm；而生物显微镜工作距离范围很少能达到20mm；因此体视显微镜景深范围较大，具有这么大的范围，所以能看见清晰的图像。金相显微镜采用的则是落射照明方式，光源主要从物镜上方射出，所以一般用做来观察不透明样本的表面。
从物镜角度来看，生物显微镜主要用于观察透明样本，采用高倍物镜盖玻片厚度(0.17)和载玻片、培养器皿厚度(1.2)，这是为了校正玻璃对于光折射的影响。不要以为金相显微镜只能观察不透明的样本，其实也有附带透射照明装置的较高级金相显微镜，可同时用于观察透明样本，而金相显微镜的物镜通常标有/0。
生物显微镜可能稍微转动调焦环，就看不清楚了。体视显微镜可以看见立体的图像一般立体显微镜最大倍数最大做到200倍左右；体视显微镜可以放置较高，生物显微镜只能放置薄片，生物显微镜的特性参数正好与体视显微镜相反。所以说，体视显微镜和生物显微镜的适应范围是不相同的，镜头的结构也有所区别。
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