岩石在整个成岩过程中经历了一系列的复杂地质事件，原来的结构几经改造，如华北奥陶系的结晶灰岩，在阴极发光显徽镜下显示出岩石原来杂乱的结构。

    沥青岩在阴极发光偏光显微镜下可以显示出大量方解石的晶体，揭示出原来方解石晶体被后来的沥青所掩盖的真相。

    晶粒结构的灰岩中方解石晶体接触非常紧密，见不到缝隙。在阴极发光偏光显微镜下则可见到沿晶间缝中有新的组合加人。方解石晶体发光极暗，沿晶体的晶间缝明显可见到桔红色的方解石细线。

    在砂岩中也可见到类似情况，在胶结物全部填满孔隙的砂岩中，不见孔隙和裂缝，碎屑顺粒与胶结物之间接触紧密。在阴极发光偏光显微镜下可以看到颖粒与胶结物之间的另外物质。