偏光显微镜可做单偏光观察、正交偏光观察和锥光观察，它能将普通光改变为偏振光进行镜检的方法，以此去鉴别某一物质是单折射或双折射性。

　　偏光显微镜被广泛地应用在矿物、化学等领域。在生物学中这就利用偏光显微镜加以区分。在植物学方面，如鉴别纤维、染色体以及细胞质与组织中是不是含有晶体。而在植物病理上中，病菌的入侵将会引起组织内化学性质的改变，同时还可以用偏光显微术进行鉴别。

　　在生物领域中，不同的纤维蛋白其显示的结构是有明显各向异性，在使用偏光显微镜的时候可让这些纤维中分子排列的详细情况。在医学分析上可以对结石、尿酸晶体检测。