电子偏光显微镜像的判断并不简单，当电子线打在样品上。

    由于构成样品的元素使电子散射，聚焦后成像，样品具有一定厚度。其中存在的元素也较为散乱，因而引起干涉像。生物样品多半先是用树脂包埋，然后切片观察。

    这些步骤对真实结构不能没有影响。例如以前是用甲基丙烯酸醋系树脂包埋，即或不染色，在良好聚焦时也可以观察。换成环氧树脂包埋后，必须用电子染色方可观察。但是用Vestopal W包埋的样品就是不染色也可以观察。环氧树脂经烧却后灰化不染色，一般聚焦也可以观察。下面介绍一些应该注意的问题。

    电镜照片像与切片的关系

    图18是最常见的电镜像，也是人们在判断上容易产生问题的地方，(1),(2)容易判断，在(3),(4)的情况下正确辨认就很不容易。用样品倾斜副件使样品倾斜后观察结构形态的位置，由于倾斜度的关系而呈(2), (3)的样子。总之，还可以与正确的图像近似，根据经验可以判断是折断、纵断还是横断。但是，有时必须借助于倾斜副件如(4)中的有粒内质网和核膜以及有窗毛细血管壁，它们的切面和原来结构不相同。

    一般在电镜像的情况下，由于此切片的厚度焦点深度深，在一张切片像中并不因上下焦点的不同而掺合在一起，而在偏光显微镜上用厚的超薄切片染色后即或用相差偏光显微镜观察，其焦点也会重合或掺合，这是众所周知的。
    立体观察

    进行立体观察时，将样品或照射系统左右稍微倾斜后照两张像，印出像片，用立体镜观察。此种方法尤其在超高压电镜下，可以用较厚切片，使立体感更强。图18中1及2的问题如要更好地解决，有时还须借助于扫描电子偏光显微镜和冰冻蚀刻的技术或负染色法等。